Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm5407E9Q7Q1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm5407E9Q7Q1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm5407E9Q7Q1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm5407E9Q7Q1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm5407E9Q7Q1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm5407E9Q7Q1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm5407E9Q7Q1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm5407E9Q7Q1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm5407E9Q7Q1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm5407E9Q7Q1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm5407E9Q7Q1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm5407E9Q7Q1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5407E9Q7Q1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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