Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga10E9Q6R1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga10E9Q6R1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga10E9Q6R1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga10E9Q6R1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga10E9Q6R1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga10E9Q6R1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga10E9Q6R1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga10E9Q6R1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga10E9Q6R1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga10E9Q6R1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga10E9Q6R1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga10E9Q6R1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga10E9Q6R1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga10E9Q6R1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga10E9Q6R1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga10E9Q6R1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga10E9Q6R1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga10E9Q6R1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga10E9Q6R1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga10E9Q6R1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga10E9Q6R1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga10E9Q6R1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms