Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm20518E9Q548 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms