Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trip11E9Q512 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trip11E9Q512 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms