Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd1E9Q492 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms