Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
5430401F13RikE9Q328 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
5430401F13RikE9Q328 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms