Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc171E9Q1U1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc171E9Q1U1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms