Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610021A01RikE9Q0Q3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms