Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG0

Gm9008, Predicted pseudogene 9008, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9008E9PVG0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9008E9PVG0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9008E9PVG0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9008E9PVG0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9008E9PVG0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9008E9PVG0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9008E9PVG0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9008E9PVG0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9008E9PVG0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9008E9PVG0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm9008E9PVG0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm9008E9PVG0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm9008E9PVG0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm9008E9PVG0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm9008E9PVG0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9008E9PVG0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms