Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc175E9PVB3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc175E9PVB3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms