Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifit3bE9PV48 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifit3bE9PV48 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms