Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prrt2E9PUL5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrt2E9PUL5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt2E9PUL5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt2E9PUL5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prrt2E9PUL5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt2E9PUL5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt2E9PUL5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt2E9PUL5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt2E9PUL5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt2E9PUL5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt2E9PUL5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms