Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Klhl3E0CZ16 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klhl3E0CZ16 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms