Protein–RNA interactions for Protein: E0CYQ0

Kctd17, MCG13350, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd17E0CYQ0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd17E0CYQ0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kctd17E0CYQ0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms