Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms