Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms