Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cldn24D3YXJ9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn24D3YXJ9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms