Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cfap58B2RW38 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms