Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700018F24RikB2RW27 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms