Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc22a28B2RT89 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms