Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms