Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms