Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Samt1A2BED8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms