Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef25A2ASI9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms