Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tubb1A2AQ07 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms