Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GabreA2AMW3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GabreA2AMW3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GabreA2AMW3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GabreA2AMW3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GabreA2AMW3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GabreA2AMW3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GabreA2AMW3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms