Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prdm12A2AJ77 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prdm12A2AJ77 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms