Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ambra1A2AH22 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ambra1A2AH22 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ambra1A2AH22 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ambra1A2AH22 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ambra1A2AH22 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ambra1A2AH22 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ambra1A2AH22 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ambra1A2AH22 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ambra1A2AH22 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms