Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
4930447F04RikA2AFR2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms