Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trav12-2A0N8N6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trav12-2A0N8N6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trav12-2A0N8N6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trav12-2A0N8N6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trav12-2A0N8N6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trav12-2A0N8N6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trav12-2A0N8N6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trav12-2A0N8N6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trav12-2A0N8N6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trav12-2A0N8N6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trav12-2A0N8N6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trav12-2A0N8N6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trav12-2A0N8N6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trav12-2A0N8N6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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