Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trbv26A0A0B4J1P5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trbv26A0A0B4J1P5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trbv26A0A0B4J1P5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trbv26A0A0B4J1P5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trbv26A0A0B4J1P5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Trbv26A0A0B4J1P5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv26A0A0B4J1P5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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