Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G7

Trbv1, T cell receptor beta, variable 1 (Fragment), mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv1A0A0B4J1G7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
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