Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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