Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 LINC01151-201ENST00000521608 571 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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FOXF1Q12946 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF1Q12946 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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