Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
E2F1Q01094 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms