Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
GTF3C6Q969F1 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
GTF3C6Q969F1 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms