Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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CCDC142Q17RM4 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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CCDC142Q17RM4 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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CCDC142Q17RM4 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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CCDC142Q17RM4 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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CCDC142Q17RM4 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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CCDC142Q17RM4 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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CCDC142Q17RM4 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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CCDC142Q17RM4 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CCDC142Q17RM4 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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