Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ALCAMQ13740 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms