Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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GPS1Q13098 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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GPS1Q13098 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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GPS1Q13098 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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GPS1Q13098 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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