Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms