Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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PTPRAP18433 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
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PTPRAP18433 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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PTPRAP18433 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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PTPRAP18433 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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PTPRAP18433 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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PTPRAP18433 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
PTPRAP18433 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
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