Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms