Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms