Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN19Q8N6F1 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN19Q8N6F1 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN19Q8N6F1 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN19Q8N6F1 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN19Q8N6F1 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CLDN19Q8N6F1 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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CLDN19Q8N6F1 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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CLDN19Q8N6F1 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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CLDN19Q8N6F1 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CLDN19Q8N6F1 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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CLDN19Q8N6F1 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN19Q8N6F1 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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