Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms