Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC5□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FHL3Q13643 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms