Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXO1Q12778 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms