Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP41Q3LFD5 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP41Q3LFD5 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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