Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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ITGB3BPQ13352 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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ITGB3BPQ13352 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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ITGB3BPQ13352 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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ITGB3BPQ13352 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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ITGB3BPQ13352 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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ITGB3BPQ13352 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ITGB3BPQ13352 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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ITGB3BPQ13352 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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ITGB3BPQ13352 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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ITGB3BPQ13352 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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ITGB3BPQ13352 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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ITGB3BPQ13352 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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