Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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USP29Q9HBJ7 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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USP29Q9HBJ7 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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USP29Q9HBJ7 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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USP29Q9HBJ7 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
USP29Q9HBJ7 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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USP29Q9HBJ7 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
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USP29Q9HBJ7 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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USP29Q9HBJ7 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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USP29Q9HBJ7 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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USP29Q9HBJ7 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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USP29Q9HBJ7 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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USP29Q9HBJ7 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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